بررسی تنوع ژنتیکی اقوام ایرانی با استفاده از STR

بررسی تنوع ژنتیکی در جمعیت‏ها با استفاده ار تعیین فراوانی آللی و پارامترهای ژنتیکی روش نوینی است که در سال‏های گذشته در بسیاری از جمعیت‏های جهان صورت گرفته و با استفاده از آن شباهت بسیاری از جمعیت‏ها به یکدیگر مشخص گردیده. شباهت جمعیت‏ها نشان‌دهنده ‏ی همسان‌بودن خزانه‏ی ژنتیکی آنها و احتمالا یکسان‌بودن آن جمعیت‏ها در گذشته است. پس این احتمال وجود دارد که این جمعیت‏ها در گذشته یک جمعیت بوده باشند و بعد‏ها به دلایل جغرافیایی و یا مهاجرت‏ها از یکدیگر جدا شده باشند. یکی از راه‏های بررسی تنوع‌ ژنتیکی در جمعیت‏ها استفاده از توالی‏های کوتاه تکراری می‏باشد .هدف این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی در دو قوم یزد و کرد (کرمانشاه) از ایران بود. بدین منظور پروفایل ژنتیکی پنجاه فرد غیر‌خویشاوند از هر یک از جمعیت‏های کرمانشاه و یزد با استفاده از کیت  ABIتهیه شد. این کیت حاوی پانزده جایگاه D8S1179،D21S11 ، D7S820،CSF ،D3S1358 ،TH01 ، D13S317، D16S539،D2S1338 ، D19S433، VWA، TPOX،D18S51 ، D5S818،FGA ،VWA ، TPOX و TH01 و ژن آمیلوژنین (برای تعیین جنسیت افراد) می‏باشد. نتایج نشان‌دادند که به جز دو جایگاه D7S820 وD19S433  در جمعیت کرمانشاه و سه جایگاه D21S11 ,D19S433 و VWA در یزد سایر جایگاه‏ها در تعادل هاردی‏واینبرگ بودند. همچنین پارامترهای پزشکی‌قانونی شامل PIC,PD,PE,MP در این مطالعه بررسی شدند. سپس دو جمعیت با جمعیت‏های کشورهای همسایه مقایسه شدند. این مطالعه نشان داد که این جایگاه‏ ها، جایگاه ‏های مناسب برای استفاده در تست‏های تعیین هویت و مطالعات جمعیتی می‏باشند. در نتیجه‏‏ ی مقایسات هم دیده شد که هر دو جمعیت یزد و کرمانشاه شباهت زیادی به جمعیت کشور ترکیه داشتند ولی با سایر کشورها متفاوت بودند. از طرفی یزد نسبت به کرمانشاه دارای جمعیت همگن‌تری بود که این مسئله می‏تواند به‌علت بکر بودن این جمعیت در طول سالیان مختلف باشد.

نوع فایل :word

تعداد صفحات :۹۵

*———————————–*

۱-۱ مقدمه

۱-۲ نشان‌گر چیست؟

۱-۳ انواع نشان‌گرهای ژنتیکی

۱-۳-۱ نشان‌گرهای مورفولوژیک

۱-۳-۲ نشان‌گرهای پروتئینی

۱-۳-۳ نشان‌گرهای مولکولیDNA  وRNA

۱-۳-۳-۱ نشان‌گرهای غیر مبتنی بر PCR

۱-۳-۳-۱-۱ تفاوت طول قطعات حاصل از هضم DNA توسط آنزیم‌های محدودگر( (RFLP

۱-۳-۳-۱-۲ پویش ژنومی نشانه‏های هضم (RLGS)

۱-۳-۳-۱-۳ ماهوارک‏ها

۱-۳-۳-۲ نشان‌گرهای مبتنی بر PCR

۱-۳-۳-۲-۱ تفاوت طول قطعه‌های حاصل از تکثیر (AFLP)

۱-۳-۳-۲-۲ DNA چندشکل تکثیرشده‏ی تصادفی (RAPD)

۱-۳-۳-۲-۳ تفاوت تک نوکلئوتیدی(SNP)

۱-۳-۳-۲-۴ نشان‌گرهای مبتنی برنقاط نشان‌مند از ردیف (STS)

۱-۳-۳-۲-۴-۱ تفاوت طول قطعه‏های قابل تکثیر(ALP)

۱-۳-۳-۲-۴-۲ ریزماهواره‌ها

۱-۴ فراوانی، توزیع و سازماندهی ریزماهواره‏ها در داخل ژنوم

۱-۵ مکانیسم ایجاد تنوع در طول توالی‏های تکراری

۱-۵-۱ کراسینگ‌اور نابرابر

۱-۵-۲ عدم جفت شدن ناشی از سرخوردنDNA  در طول رشته (خطاهای همانند‌سازی)

۱-۶ دامنه تنوع واحدهای تکرارشونده

۱-۶-۱ مدل جهش گام به گام

۱-۶-۲ مدل آللی نا‏محدود

۱-۷ مارکرهای STR

۱-۸ کاربرد مارکرهای STR

۱-۸-۱ مطالعات شجره‏ای و روابط فامیلی

۱-۸-۲ شناسایی هویت قربانیان حوادث

۱-۸-۳ تعیین هویت در موارد جنایی

۱-۸-۳-۱ شناسایی افراد مجهول الهویه

۱-۸-۳-۲ ردیابی مجرمین

۱-۸-۴ ردیابی تاریخ بشر و مطالعات جمعیتی

۱-۹ سایر کاربردهای مارکرهای STR

۱-۹-۱ جمع‌آوری سلول‌های جنینی از خون مادر

۱-۹-۲ نقشه‏ی ژنوم بیماری‏ها

۱-۹-۳ تعیین هویت افراد استفاده کننده از سرنگ مشترک

۱-۹-۴ تشخیص کلون‏های موفق

۱-۹-۵ بررسی و نظارت روی پیوند عضو

۱-۹-۶ تشخیص کایمرهای ژنتیکی

۱-۹-۷ مشخص نمودن خطوط سلولی

۱-۹-۸ تشخیص تومورهای سرطانی

۱-۱۰ روش‏های کلی شناسایی هویت افراد در سطح مولکولی

۱-۱۰-۱ روش انگشت‌نگاری ژنتیکی از طریق هیبرید‌کردن با DNA جستجوگر

۱-۱۰-۱-۱ محدودیت‏های روش انگشت‌نگاری

۱-۱۰-۲ روش پروفایلینگ

۱-۱۱ تاریخچه استفاده از مارکرهایSTR

۱-۱۲ CODIS چیست؟

۱-۱۳ کیت مورد استفاده در تعیین هویت

۱-۱۴ معرفی استان‏ها

۱-۱۴-۱ استان کرمانشاه

۱-۱۴-۱-۱ موقعیت جغرافیایی

۱-۱۴-۲ استان یَزد

۱-۱۴-۲-۱ موقعیت جغرافیایی

۱-۱۵ هدف از تحقیق:

فصل دوم

۲-۱ نمونه‌گیری

۲-۲ استخراج DNA به روش نمک اشباع

۲-۳ آماده‌سازی نمونه‌ها جهت انجام تست DNA Typing

۲-۳-۱ رسوب‌گذاری با اتانول

۲-۳-۲ تعیین غلظت نمونه‌های DNA توسط دستگاه Nanodrop

۲-۳-۳ تهیه‌ی Working Stoke

۲-۴ تست DNA Typing

۲-۴-۱ Multiplex PCR

۲-۵ مواد و تجهیزات مورد نیاز در DNA Typing

۲-۵-۱ آزمایش DNA Typing

۲-۵-۲ جداسازی قطعات

۲-۵-۲-۱ تجهیزات لازم

۲-۵-۲-۲ آماده‌سازی دستگاه جهت جداسازی قطعات

۲-۵-۲-۳ روش جداسازی قطعات

۲-۶ آنالیز داده‌ها

۳-۱ نمونه ‏ها

۳-۲ پروفایل ژنتیکی

۳-۲ نتایج حاصل از آنالیز نمونه‏ها

۳-۳ نتایج حاصل از آنالیز نمونه‏های کرمانشاه

۳-۴ نتایج حاصل از آنالیز نمونه‌های یزد

فصل چهارم

۴-۱ بحث

۴-۲ نتیجه‏گیری

۴-۳ پیشنهادات