بررسی تنوع ژنتیکی جمعیتهای بلوط ایرانی(Lindl. Quercus brantii) در بخشی از منطقه زاگرس با استفاده از مارکر مولکولی SRAP

بلوط (Quercus) یکی از مهمترین جنس­های چوبی نیمکره شمالی است. این جنس از اصلی­ترین گونه­ های درختی ایران به شمار می­رود. تاکسونومی و ارتباط تکاملی جمعیت­های بلوط ایرانی بر اساس مارکرهای  مولکولی به طور گسترده ­ای مطالعه نشده است. در این مطالعه، ارتباط ژنتیکی جمعیت­های بلوط با به کارگیری مارکر SRAP امتحان شد. پنج جمعیت بلوط از مناطق مختلف زاگرس شامل یاسوج، برمدشت، بیستون، آبدانان و خوزستان جمع­ آوری و آنالیز شدند. یازده جفت پرایمر SRAP در کل نمونه­ ها ۳۲ باند از ۱۰۰ تا ۴۰۰bp ایجاد کردند. ۲۷ تا از این باندها پلی­مورف بودند و درصد پلی­مورفیسم۳۸/۸۴% به دست آمد. ضریب تشابه نی محاسبه شد و دندروگرام بر اساس UPGMA از روی داده­های SRAP ترسیم شد. داده­های SRAP با به کارگیری نرم­افزار popgene در چهار خوشه دسته­ بندی شد. آنالیز ژنتیکی دامنه تشابه ژنتیکی بین جمعیتی نسبتاً بالا از حداقل ۸۸۱۸/۰ بین یاسوج و برمدشت تا حداکثر ۹۵۸۷/۰ بین بیستون و آبدانان را نشان داد. جمعیت­های مطالعه شده بلوط تنوع بالایی را نشان دادند: شمار آلل موثر ۴۶/۱ بود و شاخص تنوع ژنتیکی شانون (I) به طور متوسط ۶۹/۴۱% بود. جمعیت­های امتحان شده اختلاف ژنتیکی بین جمعیتی نسبتاً بالایی را (۲/۰ G_ST=) نشان دادند و جریان ژنی(N_em) 96/1 بود.

نوع فایل :word

تعداد صفحات :۸۱

*———————————–*

فصل اول: کلیات

۱-۱-    مقدمه و هدف

۱-۲-    گیاهشناسی تیره راش Fagaceae

۱-۳-    شرح تاکسونومیک جنس بلوط Quercus

۱-۳-۱ خصوصیات تاکسونومیک گونه  Quercus brantii

۱-۴-    پراکندگی جهانی این جنس

۱-۵-    پراکندگی این جنس در ایران

۱-۶-    شرایط اکولوژیکی

۱-۷-    ترکیبات شیمیایی بلوط

۱-۸-    اهمیت درمانی بلوط

۱-۹-    مصرف خوراکی بلوط

۱-۱۰-     اهمیت اقتصادی بلوط

۱-۱۱-        تنوع ژنتیکی

۱-۱۱-۱- اهمیت تنوع ژنتیکی و روش­های مختلف ارزیابی آن

۱-۱۲-   انواع نشانگرها

۱-۱۲-۱- نشانگرهای مورفولوژیکی

۱-۱۲-۲- نشانگرهای بیوشیمیایی

۱-۱۲-۳- نشانگرهای مولکولی مبتنی بر DNA

۱-۱۲-۳-۱- نشانگرهای غیر مبتنی برPCR

۱-۱۲-۳-۲- نشانگرهای مبتنی برPCR

۱-۱۲-۳-۲-۱ نشانگرPAPD

۱-۱۲-۳-۲-۲ نشانگرAFLP

۱-۱۲-۳-۲-۳ نشانگرSSR

۱-۱۲-۳-۲-۴ نشانگرISSR

۱-۱۲-۳-۲-۵ نشانگرSRAP  و مزایا و معایب آن

۱-۱۳-      کاربرد نشانگر(مارکر)هایDNA

۱-۱۴-     واکنش زنجیره­ای پلیمراز(PCR)

۱-۱۴-۱- مراحل واکنش زنجیره­ای پلیمراز

۱-۱۵-         تجزیه و تحلیل داده­ها

۱-۱۵-۱ دندروگرام

۱-۱۵-۲ تجزیه خوشه ای

۱-۱۵-۳ ضریب شباهت

۱-۱۵-۴ انتخاب الگوریتم

۱-۱۶-    بررسی کارآیی الگوریتم مورد استفاده در تجزیه کلاستر

۱-۱۷-    شاخص شانون

۱-۱۸-   بررسی تنوع و تفاوت ژنتیکی بین جمعیت­ها براساس آنالیز Nei

۱-۱۹-    سابقه تحقیق

۱-۱۵-۱- مروری بر برخی پژوهش­های انجام شده بر روی Quercus brantii Lindl.

۱-۱۵-۲- مروری بر برخی پژوهش­های انجام شده با استفاده از نشانگرSRAP

فصل دوم: مواد و روش­ها

۲-۱- انتخاب مناطق و جمعیت­ها

۲-۲- جمع­آوری نمونه ها و آماده سازی آنها

۲-۳- استخراج DNA از نمونه های گیاهی

۲-۳-۱- آماده کردن نمونه ها

۲-۳-۲- استخراج DNA

۲-۳-۲-۱- مواد موردنیاز

۲-۳-۲-۲- روش کار

۲-۴- تعیین کیفیت وکمیت DNA

۲-۵- واکنش زنجیره ای پلیمراز) (PCR

۲-۶- الکتروفورز

۲-۶-۱- محلول اتیدیوم بروماید

۲-۶-۲- تهیه ژل الکتروفورز

۲-۶-۳- الکتروفورز محصول PCR

۲-۷- تجزیه و تحلیل داده ها

فصل سوم: نتایج و بحث

۳-۱پلی­مورفیسم

۳-۲ بررسی پارامترهای اصلی تنوع ژنتیکی همه لوکوس­ها در جمعیت­های گونهQuercus brantii Lindl.

۳-۳ بررسی تنوع و تفاوت ژنتیکی بین جمعیت­ها براساس آنالیز Nei

۳-۴ شباهت و فاصله ژنتیکی بین ۵ جمعیت

۳-۵ بحث و نتیجه­گیری کلی

۳-۶ پیشنهادات