بررسی تنوع ژنتیکی درون جمعیتی و بین جمعیتی ماهی گورخری فارسی

ساختار ژنتیکی ماهی بومزاد گورخری فارسی (Aphanius farsicus) حوضه‌ی مهارلو، از چهار منبع آبی مختلف شامل پیربنو، برم‌شور، دوبنه و برم بابونک با استفاده از نشانگر هسته یی ریزماهواره  (پنج جایگاه ژنی ریزماهواره‌یی Af7/ Af20/ Af20b/ Af61/ Af18) مورد مطالعه قرار گرفت. بر اساس نتایج به‌دست آمده هر ۵ جایگاه ژنی ۱۰۰% چند شکلی را نشان دادند. میانگین تعداد آلل‌ در سطح جمعیت‌ها ۱۵۰/۳ به‌دست آمد که پایین‌تر از مقدار مشاهده شده در ماهیان آب شیرین بود. میانگین هتروزیگوسیتی مشاهده شده برابر ۹۴۸/۰ محاسبه شد که از میانگین هتروزیگوسیتی قابل انتظار (۶۵۴/۰) بیشتر بود. در بررسی تعادل هاردی-  واینبرگ، در دو جایگاه انحراف معنی‌داری (P<0.05) از تعادل مشاهده شد. نتایج به‌دست آمده از   F_STو  R_ST (013/0) تمایز ژنتیکی پایینی را میان مناطق نشان داد. همچنین بر اساس آنالیز واریانس مولکولی، تنها ۱% تنوع مشاهده شده مربوط به بین جمعیت‌ها بود. به‌نظر می‌رسد که تبادل ژنی بالایی بین جمعیت‌های مورد مطالعه ماهی گورخری فارسی در چشمه های مورد مطالعه منطق

نوع فایل :word

تعداد صفحات :۹۰

*———————————–*

فصل اول: مقدمه

۱- ۱-  معرفی تاکسون مورد مطالعه

۱- ۱- ۱-  جنس Nardo, 1827   Aphanius

۱- ۱- ۲-  ماهی گورخری فارسی Aphanius farsicus Teimori, Esmaeili & Reichnbacher, 2011

۱- ۱- ۲- ۱-  سیستماتیک

۱- ۱- ۲- ۲-  ویژگی‌های مریستیک

۱- ۱- ۲- ۳-  رنگ

۱- ۱- ۲- ۴-  زیستگاه

۱- ۲- معرفی حوضه‌ی آبی مورد مطالعه

۱- ۲- ۱-  دریاچه‌ی مهارلو

۱- ۲- ۲-  وضعیت حوضه‌ی آب ریز دریاچه‌ی مهارلو

۱- ۲- ۳-  چشمه های منتهی به دریاچه‌ی مهارلو

۱- ۲- ۴-  تشکیلات زمین شناسی

۱- ۲- ۵-  آب و هوا

۱- ۳-  مطالعات مولکولی

۱- ۳- ۱-  مطالعات تنوع ژنتیکی در ماهیان

۱- ۳- ۲-  تکنیک‌های مولکولی

۱- ۳- ۲- ۱-  تکنیک‌های DNA

۱- ۳- ۲- ۱- ۱-  تکنیک PCR

۱- ۴-  ژنوم هسته

۱- ۴- ۱-  DNAتکراری

۱- ۴- ۱- ۱-  VNTR ((Variable Number Tandem Repeat

۱- ۴- ۱- ۲- ریز ماهواره (Microsatellite)

۱- ۵- تعیین ساختار ژنتیکی جمعیت

۱- ۵- ۱-  مدل هاردی-  واینبرگ و دلیل انحراف از آن

۱- ۵- ۲-  F- Statistics

۱- ۵- ۳-  شباهت و فاصله‌ی ژنتیکی

۱- ۶-  هدف از انجام پژوهش

فصل دوم : مروری برمطالعات گذشته

۲- ۱-  مطالعات انجام شده روی جنس Aphanius

۲- ۲-  مطالعات انجام شده در مورد گونه Aphanius farsicus در ایران

فصل سوم: مواد و روش ها

۳- ۱-  نمونه برداری

۳- ۲-  مطالعات مولکولی

۳- ۲- ۱-  استخراج DNA

۳- ۲- ۱- ۱-  ارزیابی کیفیت و کمیت DNA استخراج شده

۳- ۲- ۲-  انتخاب آغازگر

۳- ۲- ۳-  انجام واکنش زنجیره‌یی پلیمراز (PCR)

۳- ۲- ۴-  الکتروفورز محصول PCR

۳- ۲- ۴- ۱-  تهیه‌ی آکریل آمید ۳۰ درصد

۳- ۲- ۴- ۲-  تهیه‌ی X)10TBE((Tris, Boric Acid,EDTA)

۳- ۲- ۴- ۳-  آمونیوم پر سولفات ۱۰٪(A.P.S) (Amonium per sulfate)

۳- ۲- ۴- ۴-  TEMED

۳- ۲- ۴- ۵-  تهیه ژل پلی آکریل آمید ۷٪

۳- ۲- ۴- ۵- ۱-  تجهیزات مورد استفاده

۳- ۲- ۴- ۵- ۲-  روش کار

۳- ۲- ۵-  رنگ آمیزی ژل پلی آکریل آمید با نیترات نقره

۳- ۲- ۵- ۱-  مواد مورد استفاده

۳- ۲- ۵- ۲-  تجهیزات مورد استفاده

۳- ۲- ۵- ۳-  روش کار

۳- ۲- ۶-  ثبت تصاویر

۳- ۲- ۷-  آنالیز آماری

فصل چهارم: نتایج

۴- ۱-  نتیجه‌ی بررسی کیفیت و کمیت DNA استخراجی

۴- ۲-  نتایج PCR

۴- ۳-  تعداد و طول آلل‌ها

۴- ۴-  فراوانی آلل‌ها

۴- ۵-  تعداد آالل واقعی (Na) و موثر (Ne)

۴- ۶-  تنوع ژنتیکی

۴- ۷-  تعادل هاردی-  واینبرگ

۴- ۸-  آنالیز آماری AMOVA

۴- ۹ جریان ژنی (ضریب مهاجرت)

۴- ۱۰-  شباهت و فاصله ژنتیکی

فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری

۵- ۱-  تنوع ژنتیکی

۵- ۲-  تعادل هاردی-  واینبرگ

۵- ۳-  تمایز ژنتیکی

۵- ۴-  جریان ژنی ( مهاجرت)

۵- ۵-  نتیجه گیری نهایی

۵- ۶- پیشنهادها

۵- ۷-  توصیه ها