اپیدمیولوژی مولکولی پروتئینP2 غشای خارجی در هموفیلوس آنفلوانزا

فصل اول: کلیات

۱-۱-تاریخچه وطبقه بندی:

۱-۲-مشخصات میکروسکوپی و ماکروسکوپی:

۱-۳- کشت:

۱-۴-آنتی ژنها وعوامل بیماریزایی

۱-۴-۱-عوامل اتصالی فیمبریه ای:

۱-۴-۲-سایرعوامل بیماریزائی:

۱-۵-بیماریها و عوارض

۱-۶- روش‏های تشخیص کلاسیک:

۱-۷-اپیدمیولوژی

۱-۷-۱-جلوگیری از پنومونی

فصل دوم: پیشینه پژوهش

۲-۱- مقدمه

۲-۲- تاریخچه

فصل سوم: روش شناسی

۳-۱- مواد و وسایل:

۳-۲- دستگاه ها:

۳-۳- محلول سازی:

۳-۳-۱- آماده سازی محیط کشت:

۳-۳-۲- محیط شکلات اگار:

۳-۳-۳- آماده سازی ژل اگارز ۱ درصد:

۳-۴- طراحی و روش اجرا:

۳-۴-۱- جمع‏آوری نمونه:

۳-۵- کشت نمونه ها:

۳-۶- تست ‌های بیوشیمیایی:

۳-۷- رنگ آمیزی:

۳-۸- نگهداری ایزوله‌های بالینی هموفیلوس آنفلوانزا در شرایط کرایو در دمای -۸۰ْ:

۳-۹- استخراج DNA

۳-۹-۱-استخراج DNA به روش جوشاندن:

۳-۱۰- بررسی کیفیت و کمیت DNAاستخراج شده:

۳-۱۱- راه اندازی و انجام PCR:

۳-۱۲- واکنشPCR

۳-۱۳- الکتروفورز محصول PCR:

۳-۱۳-۱- مواد و وسایل مورد نیاز:

۳-۱۳-۲- نحوه تهیه ژل اگارز و انجام الکتروفورز:

۳-۱۴- تفسیر ژل الکتروفورز

۳-۱۵- RFLP

۳-۱۵-۱- استخراج باند اصلی از روی ژل اگارز

۳-۱۵-۲- بررسی غلظت محصولات تخلیص شده توسط دستگاه نانودراپ:

۳-۱۶- مواد و وسایل لازم برای RFLP:

۳-۱۶-۱- روش انجام RFLP باآنزیمAlu1:

۳-۱۶-۲- انجامRFLP باآنزیم محدودالاثر EcoR1:

۳-۱۷- تعیین توالی و پردازش داده ها:

۳-۱۷-۱- ارسال نمونه‏ها جهت توالی یابی قطعه تکثیر شده:

فصل چهارم: تجزیه و تحلیل داده ها

۴-۱- تعداد نمونه‏ها و ایزولاسیون:

۴-۲-تستهای بیوشیمیایی:

۴-۳-نتایج بررسی کمیت و کیفیت DNA استخراج شده:

۴-۴- PCRژن ompP2 ایزوله‌های بالینی هموفیلوس آنفلوانزا:

۴-۵- RFLP:

۴-۶: نتایج تعیین توالی (Sequencing) و ثبت توالی‌ها دردیتابیسGeneBank/EMBL:

۴-۷- آنالیز بازهای حاصل از تعیین توالی نمونه ها:

۴-۷-۱- آنالیز بازهای حاصل از تعیین توالی ایزوله بالینی شماره ۳:

۴-۷-۲٫ آنالیز بازهای حاصل از تعیین توالی ایزوله بالینی شماره ۵:

۴-۷-۳- آنالیز بازهای حاصل از تعیین توالی ایزوله بالینی شماره ۸:

۴-۷-۴- آنالیز بازهای حاصل از تعیین توالی ایزوله بالینی شماره ۳۵:

۴-۷-۵- آنالیز بازهای حاصل از تعیین توالی ایزوله بالینی شماره ۴۷:

۴-۷-۵- آنالیز بازهای حاصل از تعیین توالی ایزوله بالینی شماره۱۴:

۴-۸- بررسی میزان شباهت و تفاوت ایزوله‌های بالینی تهران:

فصل پنجم: بحث و نتیجه گیری

۵-۱- آنالیز RFLP از ایزوله‌های بالینی:

۵-۲٫ آنالیز و بررسی جهش‌های ایجاد شده در ساختمان ژن ompP2 ایزوله شماره ۳:

۵-۲-۱آنالیز و بررسی جهش‌های ایجاد شده در ساختمان ژن ompP2 ایزوله شماره ۵:

۵-۲-۲- آنالیز و بررسی جهش‌های ایجاد شده در ساختمان ژن ompP2 ایزوله شماره ۸:

۵-۲-۳- آنالیز و بررسی جهش‌های ایجاد شده در ساختمان ژن ompP2 ایزوله شماره ۳۵:

۵-۲-۴- آنالیز و بررسی جهش‌های ایجاد شده در ساختمان ژن ompP2 ایزوله شماره ۱۴:

۵-۲-۵- آنالیز و بررسی جهش‌های ایجاد شده در ساختمان ژن ompP2 ایزوله شماره ۴۷:

۵-۳- بحث:

پیشنهادات: