ژنوتایپینگ سویه های سالمونلا انتریکا سرووار انتریتیدیس جدا شده از نمونه های بالینی از تهران بر پایه ی روش

فصل اول :کلیات تحقیق

۱-۱-  بیان مسئله

۱-۲- کلیات

۱-۲-۱، تاریخچه

۱-۲-۲، باکتریولوژی سالمونلا

۱-۲-۳، تست ها و خواص بیوشیمیایی

۱-۲-۴، طبقه بندی سالمونلا

۱-۲-۵، آنتی ژن های سالمونلا

۱-۲-۶، عوامل دخیل در بیماریزایی در سالمونلا

۱-۲-۷٫ بیماری های ناشی از سالمونلا

۱-۲-۸٫ اپیدمیولوژی سالمونلا

۱-۲-۹، تشخیص آزمایشگاهی سالمونلا

۱-۲-۱۰٫ پیشگیری و کنترل

۱-۲-۱۱، ایمنی

۱-۲-۱۲، درمان

۱-۳ – مروری بر روش های تایپینگ باکتری ها

۱-۳-۱- اصول و مبانی روش MLVA

۱-۲-۳- کلمات و اصطلاحات کاربردی در MLVA

۱-۳-۳- مزایای MLVA نسبت به سایر روش های ژنوتایپنگ

۱-۴- اهداف پایان نامه

۱-۴-۱- هدف علمی پایان نامه

۱-۴-۲- اهداف جزئی

۱-۴-۳- اهداف کاربردی

۱-۵- فرضیه ها

۱-۶- سئوالات

۱-۷- ضرورت انجام تحقیق

۱-۸- جنبه جدید بودن و نوآوری تحقیق

۱-۹- واژه نامه ها و اصطلاحات فنی

فصل دوم مروری بر ادبیات تحقیق و پیشینه تحقیق

بررسی متون:

فصل سوم :مواد وروشها

۳-۱-مواد و تجهیزات

۳-۱-۱-دستگاه ها ووسایل مورد نیاز:

۳-۱-۲-مواد مصرفی مورد نیاز:

۳-۱-۳- محیطهای کشت مورد استفاده:

۳-۲-ترکیبات و محلولهای مورد نیاز و فرمول ساخت آنها

۳-۲-۱-تهیه محلول(%۲۵) SDS:

۳-۲-۲- محلول  EDTA(5/0 مولار):

۳-۲-۳-تامپون لیز کننده سلول

۳-۲-۴- تامپون TE حاوی RNase

۳-۲-۵- بافر(۵X)TBE:

۳-۲-۷- محلول فنل-کلروفروم-ایزو آمیلیک الکل(PCI):

۳-۳- روش انجام طرح:

۳-۳-۱- نوع مطالعه:

۳-۳-۲-جامعه مورد مطالعه:

۳-۳-۳- جمع آوری اطلاعات:

۳-۳-۴- انجام امور باکتریولوژیک:

۳-۴- ژنوتایپینگ ایزوله های سالمونلا با استفاده از روش MLVA

۳-۴-۱- انجام آزمایش PCR جهت تکثیر لوکوس های VNTR

۳-۴-۲- الکتروفورز محصولات VNTR

۳-۴-۳- محاسبه ی اندازه و تعداد تکرار های VNTR

۳-۴-۴-تجزیه و تحلیل داده های VNTR

فصل چهارم یافته ها

۴-۱- نمتایج حاصل از جمع آوری نمونه ها

۴-۲- نتایچ حاصل از استخراج ژنوم باکتریایی

۴-۳- نتایج حاصل از واکنش PCR جهت تکثیر لوکوس های VNTR

۴-۴- میزان تنوع الل های VNTR

۴-۵- آنالیز داده ها با استفاده از الگوریتم Minimum Spanning Tree

۴-۶- آنالیز داده های VNTR با استفاده از روش NJ

فصل پنجم :بحث ونتیجه گیری

۵-۱- بحث

۵-۲- نتیجه گیری و جمع بندی